بر اساس آيين‌نامه جامع مديريت دانشگاه‌ها و مؤسسات آموزش عالي، پژوهشي و فناوري شرح وظايف معاونت آموزشي در دو بخش وظايف عمومي و وظايف اختصاصي به شرح ذيل تعيين شده است.

الف ـ وظايف عمومي:

1.  ابلاغ كليه مصوبات، مقـررات و آيين‌نامه‌هاي ابلاغي از سوي رئيس موسسه به واحدهاي ذيربط و پيگيري و نظارت بر حسن اجراي آن؛
2.  تدوين آيين‌نامه‌ها و دستورالعمل‌ها و دستورجلسات مرتبط با وظايف معاونت جهت پيشنهاد به مراجع ذي‌صلاح براي تصويب؛
3.  ارائه گزارش‌هاي توجيهي لازم به رييس مؤسسه در خصوص وظايف مربوطه به واحدهاي تحت نظر؛
4.  پيشنهاد افراد واجد شرايط براي تصدي سمت‌هاي مديريتي در حوزه معاونت به رياست موسسه؛
5.  نظارت بر واحدهاي وابسته به منظور حصول اطمينان از حسن اجراي وظايف آنها؛
6. برنامه‌ريزي، تنظيم فعاليت‌ها و پيشنهاد بودجه ساليانه معاونت ذيربط مطابق با اولويت‌هاي موسسه؛
7. همكاري با ساير معاونت‌ها جهت حسن اجراي برنامه‌هاي موسسه؛
8.  انجام ساير امور محوله از سوي رئيس موسسه.

 
ب ـ وظايف اختصاصي:

1. اداره و نظارت بر حسن اجراي كليه سياست‌ها، مقررات و فرآيندهاي آموزش و تحصيلات تكميلي موسسه، منطبق بر قوانين، مصوبات، مقررات و آيين‌نامه‌هاي اجرايي مربوطه با رويكرد گسترش دوره‌هاي تحصيلات تكميلي؛
2. برنامه‌ريزي امور آموزشي و تحصيلاتي تكميلي با همكاري واحدهاي ذيربط و نظارت بر حسن اجراي وظايف واحدهاي وابسته و اجراي برنامه‌ها و فعاليت‌هاي آموزشي هر دانشكده و ارزيابي آن و ارائه گزارش لازم به هيأت رييسه؛
3. پايش و ارزيابي عملكرد آموزشي دانشجويان و اعضاي هيأت علمي و مديران آموزشي واحدهاي مختلف در هر نيم‌سال و انعكاس آن به رياست دانشگاه و اعلام نتيجه ارزيابي به اعضاي هيأت علمي؛
4.  اجراي دوره‌هاي كوتاه مدت آموزشي و ضمن خدمت؛
5. برنامه‌ريزي جهت تامين امكانات و تخصيص اعتبار لازم جهت تعامل علمي ـ آموزشي حوزه و دانشگاه و ايجاد زمينه مناسب جهت نيل به علم ديني و علوم انساني اسلامي؛
6. برنامه‌ريزي آموزشي موسسه در راستاي سند چشم‌انداز، نقشه جامع علمي و آمايش سرزمين؛
7. اهتمام به برگزاري دوره‌هاي توانمندسازي و دانش‌افزايي؛
8. ارزيابي و بازنگري محتواي سرفصل‌ها به منظور به روز رساني، كارآمدي اعضاي هيأت علمي موسسه، غنابخشي و ارزش مداري و ارائه پيشنهاد لازم به وزارتين حسب مورد؛
9. برنامه‌ريزي براي ارتقـاي مهارت‌هـاي علمـي ـ تخصصـي دانشجويان جهت ورود به‌ جامعه؛
10. نظارت و ارزيابي فرآيند اجرايي شدن نقشه جامع علمي كشور در موسسه با هماهنگي وزارت متبوع؛